Hej,

I Umeå finns ett par redaktioner som ligger i startgroparna för JATS XML. Jag har vridit och vänt på de plugins som finns, utan att hitta en riktigt bra lösning. För att skapa JATS-compliant XML har vi testat DOCX to JATS XML Converter och Texture med halvdant resultat. Vi har även testat JATS XML Converter Service vid universitetet i Zagreb (https://jats.srce.hr/), även det krävde stor arbetsinsats.

Nu har redaktionen för Journal of Community Systems for Health tack vare en datakunnig kollega lyckats med att skapa ett fantastiskt arbetsflöde för att generera både PDF och JATS XML, bland annat med hjälp av GROBID. Såvitt jag kan bedöma blir det mycket hög kvalitet på XML-filerna utan en jätteinsats från redaktionen. Problemet nu är att få till bra visning i OJS; eLife Lens-pluginen kan inte generera komplett visning i webbläsaren ens med perfekt compliant XML och JATS Parser verkar inte fungera med alla OJS-versioner och alla themes. Vi står inför att antingen använda Lens och leva med halvdan visning, eller publicera XML-filerna ”as is”, utan visning på tidskriftssajten, eller (vilket jag verkligen inte vill) förenkla/nedgradera XML-filerna för att optimera visningen i Lens (detta riskerar att göra filerna non-compliant och skapa problem vid ev. indexering i framtiden).

Planen för vår plattform är att inom den närmaste tiden ta steget från 3.3 till 3.5, samt kanske även byta lösning för hosting av servern. Jag hoppas verkligen att det kan komma en stabil, JATS-compliant XML-parser för standardinstallationen av OJS snart. (Kaspar, som skapade arbetsflödet åt JCSH, skulle nog kunna göra något i plugin-väg, men han har tyvärr inte tid…)

Allt gott,

Janne

Jan Eklöf

Bibliotekarie / Librarian

Universitetsbiblioteket / University Library

Umeå universitet / Umeå University

SE-901 87 Umeå, Sweden

+46 (0)90 786 60 32

umu.se/bibliotek


När du skickar e-post till Umeå universitet innebär det att universitetet behandlar dina personuppgifter.
Läs mer här: umu.se/gdpr

By sending an email to Umeå University, the University will need to process your personal data.
For more information, please read: umu.se/en/gdpr

Från: Edvin Erdtman via OJS_swe <ojs_swe@lists.sunet.se>
Skickat: den 28 maj 2025 15:03
Till: ramana.fragola <ramana.fragola@kb.se>; ojs_swe@lists.sunet.se
Ämne: [OJS_swe] Re: XML-flöde

Hej!

Tack Ramana! Ja, tyvärr verkar JatsParserPlugin bara fungera för 3.3 enligt det som står på github-projektet. Därmed får vi svårt att uppgradera ens till 3.4.

Jag läste om det att det fanns bättre XML-hantering i 3.5, men har inte testat än.

Jag har testat Jats Template, men förstod det inte riktigt. Men som jag förstår det så är det bara i OAI-PMH-flödet som man då får ut en JATS-XML-fil som man sedan ev. kan använda som underlag för att skapa en publicerbar XML.

Med vänlig hälsning
Edvin Erdtman Fil.Dr. Vetenskaplig Redaktör

Linköpings Universitetsbibliotek liu.se och ep.liu.se
När du skickar e-post till Linköpings universitet innebär detta att Linköpings universitet behandlar dina personuppgifter. Läs mer om hur detta går till på https://liu.se/artikel/integritetspolicy-liu

Från: Ramana Fragola <Ramana.Fragola@kb.se>
Skickat: den 28 maj 2025 14:37
Till: ojs_swe@lists.sunet.se; Edvin Erdtman <edvin.erdtman@liu.se>
Ämne: SV: XML-flöde

Hej!

Vi, eller snarare tidskriftsredaktörerna, skickar de slutliga PDF- eller Word-filerna till en extern leverantör för konvertering. De resulterande XML-filerna är godtagbara, men inte perfekta.

Problemet vi stöter på är att många redaktörer tvekar att publicera XML-filer om de inte kan renderas på ett bra sätt, och som vi alla vet har eLife Lens-pluginet många problem. Jag har på min att-göra-lista att titta närmare på JATS Parser som ett alternativ, men om den inte längre underhålls aktivt är det kanske inte ett hållbart alternativ heller.

Vi har installerat version 3.5 i vår utvecklingsmiljö, och det verkar som att hanteringen av JATS-filer har förändrats något i den här versionen. JATS har nu en egen flik, och såvitt jag kan se (har inte testat så mycket än) visas inte XML-filer som knappar på samma sätt som PDF- och HTML-filer.

Har du, Edvin, eller någon annan testat JATS Template-pluginet?

Jag ska delta i PKP Sprint nästa vecka, och om jag får veta något mer om planerna för XML-hantering i 3.5, 3.6 eller längre fram kan jag återkomma.

/Ramana

Från: Edvin Erdtman via OJS_swe <ojs_swe@lists.sunet.se>
Skickat: den 27 maj 2025 12:16
Till: ojs_swe@lists.sunet.se
Ämne: [OJS_swe] XML-flöde

Hej!

Vi har börjat se över processen för att publicera XML. För det fungerar inte så bra för oss. Hur jobbar ni andra? Har ni lagt ut det på entreprenad och betalar för att skapa XML:er och PDF:er?

Vi använder följande schema (se nedan), och det fungerar (om än ganska knackigt) på OJS 3.3, men det verkar inte som att Texture utvecklas mer, och JatsParser ligger efter i utvecklingen, så det blir svårt för oss att uppgradera till 3.4 / 3.5. Vad jag förstår så kräver ORE bättre hantering i 3.6 så det är ju om vi måste vänta på den versionen då. Men nu finns ju risken att 3.3 inte har LTE-stödet längre så det kanske inte kommer säkerhetsuppdateringar till 3.3 när 3.5 får LTE.  

DOCX to JATS XML Converter Plugin

-för att konvertera Word till XML.

Texture Editor Plugin och manuell redigering

-för att redigera XML

JATSParser Plugin

-för att rendera XML:en till HTML / PDF

Med vänlig hälsning

Edvin Erdtman Fil.Dr.
Vetenskaplig Redaktör

Linköpings Universitetsbibliotek
581 83 Linköping
Telefon: 013- 28 29 62

E-post: edvin.erdtman@liu.se

Besöksadress: Studenthuset, våning 6, Campus Valla, Linköping

Besök oss gärna på: liu.se och ep.liu.se

När du skickar e-post till Linköpings universitet innebär detta att Linköpings universitet behandlar dina personuppgifter. Läs mer om hur detta går till på https://liu.se/artikel/integritetspolicy-liu